Lima kekuatan:
● Instrumen dikonfigurasikan dengan ekstraksi asam nukleat dan langkah pemurnian
● Instrumen dikonfigurasi dengan modul ekstraksi ultrasonik
● Instrumen dikonfigurasikan dengan otomatis penuh
● Instrumen dikonfigurasi dengan amplifikasi suhu variabel
● Instrumen dikonfigurasi dengan kit reagen yang tertutup sepenuhnya
1.Apakah reagen pendeteksi asam nukleat perlu diekstraksi dan dimurnikan?
Prinsip deteksi asam nukleat adalah sebagai berikut: di bawah aksi primer, DNA polimerase digunakan untuk melakukan amplifikasi reaksi berantai pada templat DNA/RNA (memerlukan transkripsi balik NA), dan kemudian jumlah sinyal fluoresen yang dilepaskan dideteksi untuk menentukan apakah sampel mengandung asam nukleat (DNA/RNA) patogen yang akan dideteksi.
1)Sampel yang belum diekstraksi atau dimurnikan mungkin mengandung banyak komponen yang mempengaruhi hasil akhir: nuklease (yang dapat melarutkan asam nukleat target dan menyebabkan negatif palsu), protease (yang dapat mereduksi DNA polimerase dan menyebabkan negatif palsu), logam berat garam (yang menyebabkan inaktivasi sintase dan menyebabkan positif palsu), PH terlalu asam atau terlalu basa (yang dapat menyebabkan kegagalan reaksi), RNA tidak lengkap (menyebabkan kegagalan transkripsi balik negatif palsu).
2)Beberapa sampel sulit untuk diamplifikasi secara langsung: Gram-positif dan beberapa parasit, karena dinding selnya yang tebal dan struktur lainnya, jika tidak melalui proses ekstraksi dan pemurnian asam nukleat, kit bebas ekstraksi mungkin gagal untuk hal tersebut. sampel.
Oleh karena itu, disarankan untuk memilih alat tes atau instrumen yang dikonfigurasi dengan langkah ekstraksi asam nukleat.
2. Ekstraksi kimia atau ekstraksi fragmentasi ultrasonik fisik?
Secara umum, ekstraksi kimia dapat diterapkan pada sebagian besar perlakuan awal dan Pemurnian.Namun, pada bakteri Gram-positif berdinding tebal dan beberapa parasit, ekstraksi kimia juga tidak dapat memperoleh templat asam nukleat yang efektif, sehingga menghasilkan deteksi negatif palsu.Selain itu, ekstraksi kimia sering kali menggunakan bahan yang kuat, jika elusinya tidak menyeluruh, alkali kuat akan mudah masuk ke dalam sistem reaksi, sehingga menghasilkan hasil yang tidak akurat.
Fragmentasi ultrasonik menggunakan penghancuran fisik, yang telah berhasil digunakan oleh GeneXpert, perusahaan terkemuka di bidang POCT untuk penggunaan manusia, dan memiliki keunggulan absolut dalam ekstraksi asam nukleat dari beberapa sampel kompleks (seperti Mycobacterium tuberkulosis).
Oleh karena itu, disarankan untuk memilih alat tes atau instrumen yang dikonfigurasi dengan langkah ekstraksi asam nukleat.dan optimal jika terdapat modul ekstraksi ultrasonik.
3. Manual, semi-otomatis dan otomatis penuh?
Ini adalah masalah biaya tenaga kerja dan efisiensi kerja.Saat ini, rumah sakit hewan peliharaan tidak memiliki staf yang cukup, dan ekstraksi serta deteksi asam nukleat merupakan pekerjaan yang memerlukan keterampilan dan pengalaman tertentu.Tidak ada keraguan bahwa mesin ekstraksi dan pendeteksi asam nukleat otomatis adalah pilihan yang tepat.
4. Amplifikasi suhu konstan atau amplifikasi suhu variabel?
Reaksi amplifikasi adalah hubungan deteksi asam nukleat, dan teknologi profesional yang terlibat dalam hubungan ini sangatlah kompleks.Secara kasar, enzim digunakan untuk memperkuat asam nukleat.Dalam proses amplifikasi, sinyal fluoresensi yang diperkuat atau sinyal fluoresensi yang tertanam terdeteksi.Secara umum, semakin dini sinyal fluoresensi muncul, semakin besar kandungan gen target dalam sampel.
Amplifikasi suhu konstan adalah amplifikasi asam nukleat pada suhu tetap, sedangkan amplifikasi suhu variabel adalah amplifikasi siklik sesuai dengan denaturasi-anil-ekstensi.Waktu amplifikasi suhu konstan telah dilakukan, sedangkan waktu amplifikasi suhu variabel sangat dipengaruhi oleh laju kenaikan dan penurunan suhu instrumen (saat ini, banyak produsen yang mampu melakukan 40 siklus amplifikasi dalam waktu sekitar 30 menit).
Jika kondisi laboratorium baik dan zonasinya ketat, maka dapat dikatakan bahwa perbedaan akurasi antara keduanya tidak akan terlalu besar.Namun, amplifikasi suhu yang bervariasi akan mensintesis lebih banyak produk asam nukleat dalam waktu yang relatif lebih singkat.Untuk laboratorium yang tidak memiliki zonasi yang ketat dan personel yang memiliki pelatihan profesional, risiko kebocoran aerosol asam nukleat akan lebih besar, positif palsu terjadi begitu kebocoran terjadi, dan hal ini sangat sulit dihilangkan.
Selain itu, amplifikasi suhu konstan juga lebih rentan terhadap amplifikasi non-spesifik ketika sampelnya kompleks (suhu reaksi relatif lebih rendah, dan semakin tinggi suhu ekstensi, semakin baik spesifisitas pengikatan primer).
Sejauh menyangkut teknologi saat ini, amplifikasi suhu variabel lebih dapat diandalkan.
5. Bagaimana cara menghindari risiko kebocoran produk amplifikasi asam nukleat?
Saat ini, banyak produsen memilih tabung PCR tipe kelenjar sebagai tabung reaksi asam nukleat, yang disegel dengan gesekan, dan denaturasi suhu dalam amplifikasi PCR suhu variabel mencapai 90 derajat
Celcius.Proses pemuaian yang berulang dengan panas dan kontraksi dengan dingin merupakan tantangan besar bagi penyegelan tabung PCR, dan tabung PCR tipe kelenjar relatif mudah menyebabkan kebocoran.
Sebaiknya lakukan reaksi dengan kit/tabung yang tertutup rapat untuk menghindari kebocoran produk reaksi.Akan sempurna jika ada kit yang tersegel sepenuhnya untuk ekstraksi dan deteksi asam nukleat.
Jadi, mesin ekstraksi dan deteksi asam nukleat otomatis baru dari New Tech memiliki lima pilihan optimal di atas.
Waktu posting: 09 Agustus 2023